10 июня 2010 г. в городе Оше на юге Киргизии из-за межнациональных разногласий произошла драка между группами киргизов и узбеков, которые населяли город примерно пополам. Стычка началась около казино и уже к утру следующего дня переросла в массовые беспорядки. Власти республики не смогли быстро отреагировать на ситуацию, а слухи об изнасиловании в женском общежитии, которое якобы совершили узбеки, только ее усугубили. Толпы молодых киргизов, вооруженных палками, камнями, холодным и огнестрельным оружием, а также бутылками с зажигательной смесью, стали нападать на кварталы с узбекским населением (махалли).

Временное правительство Киргизии объявило в Оше чрезвычайное положение и комендантский час, однако ситуация продолжала выходить из-под контроля. Погромы узбекских кварталов, массовые поджоги и расстрелы вынудили десятки тысяч людей бежать из своих домов. 11 июня власти Узбекистана открыли границу, приняв в общей сложности 111 000 беженцев, в основном женщин и детей. На территории республики были развернуты лагеря для их размещения.

Погромы произошли на фоне глубоких и нерешенных проблем: в июне 1990 г. Ош уже пережил масштабные межэтнические столкновения. Расследование тех событий (около 4000 инцидентов и 3215 зарегистрированных преступлений) было избирательным: из 1500 возбужденных дел до суда дошло лишь 300. Были осуждены около 300 человек, но к реальным длительным срокам приговорены только 48 (примерно 80% – узбеки). Почти все осужденные позже были амнистированы.

Июньские события разворачивались на фоне острого политического кризиса после свержения 7 апреля 2010 г. президента Киргизии Курманбека Бакиева. Временное правительство Розы Отунбаевой с трудом контролировало юг страны, где нарастала межэтническая напряженность. 13 мая сторонники Бакиева захватили администрации городов Оша, Джалал-Абада и Баткена. На следующий день сподвижники лидера узбекской общины Кадыржана Батырова отбили здание в Джалал-Абаде и сожгли дома Бакиева. 19 мая митинг против Батырова привел к сожжению принадлежавшего ему Университета дружбы народов. Обстановка резко обострилась после убийства 7 июня криминального авторитета Айбека Мирсидикова (Черный Айбек), близкого к прежним властям.

К 12 июня конфликт в Оше достиг своего пика. Некоторые из оставшихся в городе узбеков стали строить баррикады для защиты, в частности, на перекрестке Сампа. Также они заблокировали стратегически важную дорогу Ош-Бишкек в Наримане, пригороде Оша, чтобы остановить продвижение агрессивно настроенных групп из сельской местности. В тот же день волна погромов распространилась на соседний город Джалал-Абад.

Малочисленные и деморализованные силы правопорядка, которые в ряде случаев бездействовали или проявляли предвзятость, не смогли остановить насилие ни в Оше, ни в Джалал-Абаде. На фоне хаоса 13 июня в Наримане произошло убийство начальника милиции Кара-Сууйского района (киргиза) и его водителя. В тот же день временное правительство Киргизии, пытаясь взять ситуацию под контроль, объявило в Джалал-Абадской области чрезвычайное положение и комендантский час.

На третий день столкновений власти разрешили силовикам и военным применять оружие. К 14 июня в Оше наступила относительная стабилизация, но спорадические нападения продолжались. В Джалал-Абаде ситуация оставалась напряженной: днем шли столкновения, ночью они сменялись мародерством. Власти смогли полностью взять под контроль ситуацию только 15 июня. В обоих городах были инициированы переговоры о перемирии между лидерами киргизской и узбекской общин.

После обращения Розы Отунбаевой к спецпредставителю Парламентской ассамблеи ОБСЕ по Центральной Азии Киммо Кильюнену была создана Международная независимая комиссия по расследованию событий на юге Киргизии. Согласно ее отчету, в ходе беспорядков погибли 470 человек, большинство из которых – 74% – этнические узбеки. Генпрокуратура сообщала о 426 погибших. По данным Минздрава Киргизии, более 1900 человек были госпитализированы, преимущественно – с огнестрельными ранениями. Власти Узбекистана сообщали о 2800 раненных среди беженцев. Согласно выводам комиссии, участники нападений завладели оружием и боеприпасами, которые находились в распоряжении военных и милиции. 10 сотрудников МВД были убиты.

По данным спутникового центра ООН ЮНОСАТ, в результате столкновений и погромов на юге Киргизии пострадало порядка 3000 зданий. СМИ оценивали материальный ущерб в $80 млн. Было возбуждено 5162 уголовных дела, обвинения предъявлены более 500 лицам. Однако впоследствии к реальному лишению свободы были приговорены около 300 человек, что объяснялось сложностями следствия, недостаточностью доказательств и давлением на потерпевших. Подавляющее число арестованных являлись узбеками.

Независимая комиссия возложила вину за случившееся на власти Киргизии. Эксперты пришли к выводу, что погромы в Оше и соседних городах можно было предотвратить. «Временное правительство либо не признало, либо недооценило ухудшение межэтнических отношений на юге. Аргументы, выдвинутые президентом Отунбаевой о том, что всплеск насилия был такого масштаба, что временному правительству было сложно его сдержать, не освобождает правительство от его основной обязанности по защите населения», – отмечалось в докладе. Международные партнеры Киргизии отреагировали на случившееся сдержано. Так, президент России Дмитрий Медведев объяснил, что Организация Договора о коллективной безопасности (ОДКБ) не может вмешиваться в ситуацию, поскольку это внутреннее дело страны.