Владимир Якунин и последний министр путей сообщения Вадим Морозов РЖД была образована в 2003 г. Ей были переданы активов упраздненного почти сразу после создания РЖД министерства путей сообщения. В постановлении правительства от 2001 г., посвященном железнодорожной реформе, говорится, что изменения в отрасли необходимы, чтобы демонополизировать отрасль, повысить качество услуг и разделить функции государственного регулирования и хозяйственной деятельности.

Отставание реформы от плана Изначально предполагалось, что реформа завершится к концу 2010 г. К этому времени правительство хотело выделить из РЖД грузовых и пассажирских перевозчиков и передать их в частные руки, а самой госкомпании оставить лишь железнодорожные пути и соответствующую инфраструктуру без вагонов и локомотивов. При Владимире Якунине реформа затормозилась и к 2014 г. далека от завершения.

Первая грузовая компания В сфере пассажирских перевозок реформа практически не продвинулась - hейсы дальнего следования в России по-прежнему выполняет РЖД через свою "дочку" - "Федеральную пассажирскую компанию". В сфере грузовых перевозок изменения зашли заметно дальше. Например, в 2011 г. РЖД продала структурам Владимира Лисина 75% минус одна акция «Первой грузовой компанию» (в 2012 г. эти структуры стали стопроцентными владельцами ПГК). Доля ПГК в грузоперевозках России по итогам 2012 г. превышала 14%, за год компания перевезла по сети РЖД почти 185 млн т. грузов.

"Сапсан" Строительство высокоскоростной магистрали из Москвы в Санкт-Петербург обсуждалось с начала 1990 гг, но в итоге возведение трассы так и не началось. Проект ВСМ был положен в долгий ящик, а вместо высокоскоростной магистрали в 2009 г. РЖД запустили "Сапсаны" - новые поезда, разработанные немецкой Siemens специально для России, но передвигающиеся по тем же рельсам, что и другие поезда. "Сапсаны" курсируют между Москвой и Санкт-Петербургом, а также между Москвой и Нижним Новгородом. До Петербурга из столицы можно добраться "Сапсаном" за три часа и 40 минут, до Нижнего Новгорода - за 3 часа и 55 минут. Средняя скорость "Сапсанов" не превышает 180 км в час. Для сравнения, аналогичные поезда Valero, изготовленные Siemens для Испании, преодолевают расстояние между Барселоной и Мадридом (621 км) за 2 часа и 25 минут со средней скоростью около 260 км в час.

Allegro Еще один знаковый для РЖД поезд - Allegro. Он курсирует с конца 2010 г. между Санкт-Петербургом и Хельсинки. Эксплуатацию поезда осуществляет совместное предприятие РЖД и "Финляндских железных дорог" (Suomen Valtion Rautatiet), а построен Allegro был в Италии и входит в семейство электропоездов Pendolino.

Пригородное сообщение За последние 10 лет сильно изменились и пригородные перевозки, особенно рядом с крупными городами. РЖД сделали ставку на развитие экспрессов по популярным направлениям и установку турникетов на самых оживленных станциях. Несмотря на эти усилия, организация пригородного сообщения не вышла на рентабельный уровень и требует субсидий со стороны регионов. Им, в свою очередь, помогает федеральный бюджет. В конце 2013 г. Минфин предложил сокращать соответствующие дотации регионам, сведя их к нулю к 2016 г.

Транссиб, БАМ и другие проекты Одним из главных инфраструктурных проектов РЖД стала модернизация Транссиба и БАМа. Споры о том, кто должен финансировать стройку на 562 млрд руб., завершились в 2013 г., когда президент России Владимир Путин разрешил использовать средства Фонда национального благосостояния для оплаты инфраструктурных проектов. РЖД должны получить из ФНБ 150 млрд руб. Второй проект РЖД, который претендует на государственные деньги, - высокоскоростная магистраль Москва - Екатеринбург - пока не одобрен. Строительство этой железной дороги оценивается более чем в 1 трлн руб.

КИТ Финанс и Gefco Хотя Владимир Якунин и жалуется на отсутствие средств на инфраструктурные проекты, РЖД под его руководством совершили по крайней мере две крупные непрофильные сделки. Во время кризиса РЖД помогли спасти "КИТ Финанс", выкупив 90% банка вместе с алмазодобывающей "Алросой", а в 2012 г. монополия приобрела 75% французского логистического оператора Gefco у концерна Peugeout-Citroen.

Шубохранилище Летом 2013 г. в интернете появились фотографии загородной резиденции, которую блогеры, а затем и политик Алексей Навальный приписали Владимиру Якунину. Больше всего в роскошной резиденции блогеров поразило отдельное шубохранилище. Сын Владимира Якунина Андрей рассказывал "Ведомостям", что до 2011 г. участок земли в подмосковном Акулинине действительно принадлежала президенту РЖД, но "все остальное - не более чем домыслы".

"Ласточки" на Олимпиаде В начале июня 2014 г. Якунин, вместе с другими руководителями госкомпаний, получил орден Александра Невского за организацию Олимпиады в Сочи. Как рассказывал Якунин в своем блоге в ЖЖ, за три олимпийских недели РЖД перевезли около 3 млн пассажиров. Для перевозок между городом Сочи, аэропортом, Олимпийским парком и Красной поляной использовались «Ласточки», электропоезда, созданные на базе Siemens Desiro для российских дорог.